MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Neisseria meningitidis M01-240149 chromosome

Total Repeats: 39088

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017514	TATCCA	2	12	15	26	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385340992
2	NC_017514	CCT	2	6	178	183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385340992
3	NC_017514	CCAA	2	8	228	235	50 %	0 %	0 %	50 %	385340992
4	NC_017514	ATC	2	6	304	309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385340992
5	NC_017514	AGA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385340992
6	NC_017514	CTC	2	6	409	414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385340992
7	NC_017514	AAC	2	6	416	421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385340992
8	NC_017514	AACC	2	8	427	434	50 %	0 %	0 %	50 %	385340992
9	NC_017514	TGC	2	6	613	618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385340993
10	NC_017514	GC	3	6	673	678	0 %	0 %	50 %	50 %	385340993
11	NC_017514	GAT	2	6	703	708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385340993
12	NC_017514	TTGTT	2	10	722	731	0 %	80 %	20 %	0 %	385340993
13	NC_017514	A	6	6	807	812	100 %	0 %	0 %	0 %	385340993
14	NC_017514	T	7	7	834	840	0 %	100 %	0 %	0 %	385340993
15	NC_017514	CTT	3	9	941	949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385340994
16	NC_017514	CTT	2	6	1046	1051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385340994
17	NC_017514	GCA	2	6	1130	1135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385340994
18	NC_017514	GCG	2	6	1141	1146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385340994
19	NC_017514	TCG	2	6	1150	1155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385340994
20	NC_017514	T	6	6	1194	1199	0 %	100 %	0 %	0 %	385340994
21	NC_017514	TCAAA	2	10	1430	1439	60 %	20 %	0 %	20 %	385340994
22	NC_017514	TCG	3	9	1471	1479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385340994
23	NC_017514	GCCCA	2	10	1486	1495	20 %	0 %	20 %	60 %	385340994
24	NC_017514	GC	3	6	1497	1502	0 %	0 %	50 %	50 %	385340994
25	NC_017514	CGC	2	6	1568	1573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385340994
26	NC_017514	T	7	7	1586	1592	0 %	100 %	0 %	0 %	385340994
27	NC_017514	GTT	2	6	1680	1685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385340994
28	NC_017514	GTC	2	6	1692	1697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385340994
29	NC_017514	GTC	2	6	1731	1736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385340994
30	NC_017514	AAT	2	6	1782	1787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385340994
31	NC_017514	GTC	2	6	1791	1796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385340994
32	NC_017514	GTCC	2	8	1836	1843	0 %	25 %	25 %	50 %	385340994
33	NC_017514	GAC	2	6	1878	1883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385340994
34	NC_017514	GCC	2	6	1931	1936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385340994
35	NC_017514	GCG	2	6	1938	1943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385340994
36	NC_017514	CTT	2	6	1961	1966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385340994
37	NC_017514	CTT	2	6	1997	2002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385340994
38	NC_017514	TGC	2	6	2003	2008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385340994
39	NC_017514	AGT	2	6	2015	2020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385340994
40	NC_017514	CTT	2	6	2054	2059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385340994
41	NC_017514	GCG	2	6	2073	2078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385340994
42	NC_017514	GACC	2	8	2117	2124	25 %	0 %	25 %	50 %	385340994
43	NC_017514	GAT	2	6	2142	2147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385340994
44	NC_017514	CGG	2	6	2159	2164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385340994
45	NC_017514	CGC	2	6	2255	2260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385340994
46	NC_017514	ATG	2	6	2311	2316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385340994
47	NC_017514	A	6	6	2523	2528	100 %	0 %	0 %	0 %	385340995
48	NC_017514	GCA	2	6	2578	2583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385340995
49	NC_017514	T	7	7	2590	2596	0 %	100 %	0 %	0 %	385340995
50	NC_017514	TCC	2	6	2658	2663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385340995
51	NC_017514	CCG	2	6	2671	2676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385340995
52	NC_017514	CAC	2	6	2708	2713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385340995
53	NC_017514	CGGA	2	8	2741	2748	25 %	0 %	50 %	25 %	385340995
54	NC_017514	TGT	2	6	2749	2754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385340995
55	NC_017514	GC	3	6	2801	2806	0 %	0 %	50 %	50 %	385340995
56	NC_017514	CCG	2	6	2831	2836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385340995
57	NC_017514	T	6	6	2864	2869	0 %	100 %	0 %	0 %	385340995
58	NC_017514	CGG	2	6	2977	2982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385340995
59	NC_017514	CGG	2	6	3017	3022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385340995
60	NC_017514	GCCC	2	8	3031	3038	0 %	0 %	25 %	75 %	385340995
61	NC_017514	GCC	2	6	3197	3202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385340996
62	NC_017514	GAT	2	6	3243	3248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385340996
63	NC_017514	GCA	2	6	3261	3266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385340996
64	NC_017514	ATC	2	6	3316	3321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385340996
65	NC_017514	CAT	2	6	3331	3336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385340996
66	NC_017514	CG	3	6	3339	3344	0 %	0 %	50 %	50 %	385340996
67	NC_017514	TTG	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385340996
68	NC_017514	GCG	2	6	3396	3401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385340996
69	NC_017514	GCA	2	6	3425	3430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385340996
70	NC_017514	TTC	2	6	3439	3444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385340996
71	NC_017514	GGC	2	6	3457	3462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385340996
72	NC_017514	TGC	2	6	3471	3476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385340996
73	NC_017514	GACAT	2	10	3506	3515	40 %	20 %	20 %	20 %	385340996
74	NC_017514	GCC	2	6	3667	3672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385340997
75	NC_017514	ACA	2	6	3722	3727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385340997
76	NC_017514	TGCC	2	8	3812	3819	0 %	25 %	25 %	50 %	385340997
77	NC_017514	A	6	6	3844	3849	100 %	0 %	0 %	0 %	385340997
78	NC_017514	CGT	2	6	4011	4016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385340997
79	NC_017514	ACAA	2	8	4037	4044	75 %	0 %	0 %	25 %	385340997
80	NC_017514	A	6	6	4067	4072	100 %	0 %	0 %	0 %	385340997
81	NC_017514	CGG	2	6	4347	4352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385340998
82	NC_017514	CAA	2	6	4386	4391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385340998
83	NC_017514	CCG	2	6	4639	4644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385340998
84	NC_017514	CGG	2	6	4728	4733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385340998
85	NC_017514	AAC	3	9	4736	4744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385340998
86	NC_017514	CGT	2	6	4764	4769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385340998
87	NC_017514	CTG	2	6	4783	4788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385340998
88	NC_017514	CGA	2	6	4794	4799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385340998
89	NC_017514	AAC	2	6	4872	4877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385340998
90	NC_017514	TCG	2	6	4883	4888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385340998
91	NC_017514	GAC	2	6	4949	4954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385340998
92	NC_017514	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385340999
93	NC_017514	CG	3	6	4997	5002	0 %	0 %	50 %	50 %	385340999
94	NC_017514	CGC	2	6	5143	5148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385340999
95	NC_017514	CCG	3	9	5170	5178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385340999
96	NC_017514	CTG	2	6	5208	5213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385340999
97	NC_017514	GC	3	6	5214	5219	0 %	0 %	50 %	50 %	385340999
98	NC_017514	ACA	2	6	5233	5238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385340999
99	NC_017514	AGA	2	6	5255	5260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385340999
100	NC_017514	GAA	2	6	5268	5273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385340999
101	NC_017514	CGCC	2	8	5365	5372	0 %	0 %	25 %	75 %	385340999
102	NC_017514	TTTC	2	8	5493	5500	0 %	75 %	0 %	25 %	385340999
103	NC_017514	AGA	2	6	5570	5575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385340999
104	NC_017514	GC	3	6	5599	5604	0 %	0 %	50 %	50 %	385340999
105	NC_017514	CGT	2	6	5608	5613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385340999
106	NC_017514	CCG	2	6	5618	5623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385340999
107	NC_017514	CCG	3	9	5662	5670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385340999
108	NC_017514	GCT	2	6	5693	5698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385340999
109	NC_017514	CT	3	6	5697	5702	0 %	50 %	0 %	50 %	385340999
110	NC_017514	TCT	2	6	5764	5769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385340999
111	NC_017514	CCA	2	6	5836	5841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385340999
112	NC_017514	A	6	6	5868	5873	100 %	0 %	0 %	0 %	385340999
113	NC_017514	T	6	6	6050	6055	0 %	100 %	0 %	0 %	385341000
114	NC_017514	TCA	2	6	6069	6074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385341000
115	NC_017514	AAGGC	2	10	6082	6091	40 %	0 %	40 %	20 %	385341000
116	NC_017514	CG	3	6	6098	6103	0 %	0 %	50 %	50 %	385341000
117	NC_017514	GCAC	2	8	6155	6162	25 %	0 %	25 %	50 %	385341000
118	NC_017514	GCC	2	6	6177	6182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341000
119	NC_017514	CGG	2	6	6187	6192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385341000
120	NC_017514	CGC	2	6	6287	6292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341001
121	NC_017514	AGC	2	6	6303	6308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385341001
122	NC_017514	GGCA	2	8	6312	6319	25 %	0 %	50 %	25 %	385341001
123	NC_017514	CCG	2	6	6355	6360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341001
124	NC_017514	CGC	2	6	6405	6410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341001
125	NC_017514	TGCTT	2	10	6441	6450	0 %	60 %	20 %	20 %	385341001
126	NC_017514	TCAAAC	2	12	6496	6507	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385341001
127	NC_017514	CGG	2	6	6539	6544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385341001
128	NC_017514	GCG	3	9	6565	6573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385341001
129	NC_017514	ATC	2	6	6595	6600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385341001
130	NC_017514	TCGGCA	2	12	6640	6651	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385341001
131	NC_017514	ACG	2	6	6667	6672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385341001
132	NC_017514	TCGG	2	8	6676	6683	0 %	25 %	50 %	25 %	385341001
133	NC_017514	GCC	2	6	6706	6711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341001
134	NC_017514	T	7	7	6725	6731	0 %	100 %	0 %	0 %	385341001
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251	NC_017514	TCCCG	2	10	12738	12747	0 %	20 %	20 %	60 %	385341006
252	NC_017514	TCA	2	6	12763	12768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385341006
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256	NC_017514	AGC	2	6	12975	12980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385341006
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259	NC_017514	GC	3	6	13170	13175	0 %	0 %	50 %	50 %	385341007
260	NC_017514	AGT	2	6	13179	13184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385341007
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262	NC_017514	ACC	2	6	13298	13303	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385341007
263	NC_017514	GGCA	2	8	13316	13323	25 %	0 %	50 %	25 %	385341007
264	NC_017514	ATG	2	6	13424	13429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385341007
265	NC_017514	CAG	2	6	13444	13449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385341007
266	NC_017514	GCC	2	6	13582	13587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341007
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269	NC_017514	TCG	2	6	13880	13885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385341007
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272	NC_017514	GC	3	6	14078	14083	0 %	0 %	50 %	50 %	385341007
273	NC_017514	CCCG	2	8	14089	14096	0 %	0 %	25 %	75 %	385341007
274	NC_017514	CG	3	6	14117	14122	0 %	0 %	50 %	50 %	385341007
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281	NC_017514	GCC	2	6	14218	14223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385341007
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295	NC_017514	GC	3	6	16246	16251	0 %	0 %	50 %	50 %	385341008
296	NC_017514	GC	6	12	16284	16295	0 %	0 %	50 %	50 %	385341008
297	NC_017514	TCG	2	6	16300	16305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385341008
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303	NC_017514	GCA	2	6	16850	16855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385341008
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376	NC_017514	GGT	2	6	23525	23530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385341015
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382	NC_017514	GTC	2	6	23920	23925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385341016
383	NC_017514	CT	3	6	23960	23965	0 %	50 %	0 %	50 %	385341016
384	NC_017514	CGG	2	6	23967	23972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385341016
385	NC_017514	TGCGGC	2	12	23977	23988	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	385341016
386	NC_017514	TTTG	2	8	23997	24004	0 %	75 %	25 %	0 %	385341016
387	NC_017514	TTG	2	6	24065	24070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385341016
388	NC_017514	CG	3	6	24134	24139	0 %	0 %	50 %	50 %	385341016
389	NC_017514	TGG	2	6	24144	24149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385341016
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497	NC_017514	TCCGC	2	10	29632	29641	0 %	20 %	20 %	60 %	385341019
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